Archives de l’auteur : Timothée Giraud

Analyse des données spatiales appliquée avec R

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Ces ouvrages ne sont en fait disponibles que depuis les locaux de mon institution, désolé pour les faux espoirs suscités par cette news.
Pour ne pas repartir les mains vides, l’édition 2008 de l’ouvrage Applied Spatial Data Analysis with R de Roger S. Bivand, Edzer J. Pebesma et Virgilio Gómez-Rubio est disponible en ligne ici. Ce livre est écrit par les auteurs du package sp, fondamental pour l’analyse de l’information géographique avec R.
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L’éditeur Springer permet (en ce moment) le téléchargement gratuit de 52 ouvrages de sa collection Use R! (format pdf et epub).
Ces livres couvrent en grand nombre de domaines (introduction à R, analyse de réseaux, data mining, analyse des données spatiales…) et sont en anglais.

Description de la collection:

6991This series of inexpensive and focused books on R will publish shorter books aimed at practitioners. Books can discuss the use of R in a particular subject area (e.g., epidemiology, econometrics, psychometrics) or as it relates to statistical topics (e.g., missing data, longitudinal data). In most cases, books will combine LaTeX and R so that the code for figures and tables can be put on a website. Authors should assume a background as supplied by Dalgaard’s Introductory Statistics with R or other introductory books so that each book does not repeat basic material. Springer.

 

Le package cartography

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cartocomp

Conçu comme une boite à outil cohérente et documentée dédiée à la cartographie thématique, le package cartography permet de créer des cartes avec R.
 
Les représentations les plus classiques sont bien entendu disponibles (symboles proportionnels, cartes choroplèthes, cartes qualitatives) et d’autres modes de représentations souvent difficiles à mettre en œuvre dans un logiciel de cartographie sont aussi proposées (cartes de flux, discontinuités, carroyages, cartes par points…).
Le package propose également quelques fonctionnalités supplémentaires : palettes de couleurs (simples et doubles gradations dissymétriques), éléments d’habillage (échelle , orientation, titre, sources, étiquettes…), des légendes paramétrables, et enfin l’accès à des API cartographiques…
 
Ce package est développé au sein de l’UMS RIATE par Timothée Giraud et Nicolas Lambert. La version stable est sur le CRAN, la version de développement est hébergée sur GitHub.
 
Pour avoir un aperçu rapide de la manière dont on peut utiliser le package, cette vignette développe, via des scripts commentés, quelques exemples de création de cartes.

Ci-dessous vous trouverez le code qui permet de générer la composition cartographique réalisée avec le package : Continuer la lecture →

ClustGeo : Un package de CAH avec contraintes de proximité géographique

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Lors des Quatrièmes Rencontres R (24-26 juin 2015 à Grenoble), Amaury Labenne (de l’IRSTEA) a présenté son package ClustGeo qui permet de réaliser des Classifications Ascendantes Hiérarchiques avec contraintes de proximité géographique. Voici la présentation qu’il en fait :

La Classification Ascendante Hierarchique (CAH) est une méthode bien connue de clustering d’observations qui consiste à regrouper dans une même classe des observations qui se ressemblent. Cependant, lorsque les observations sont des unités spatiales, on désire parfois que des observations proches géographiquement se retrouvent dans une même classe sans trop dégrader la qualité de la partition. La méthode hclustgeo du package ClustGeo permet d’intégrer de l’information géographique au sein de la CAH en utilisant un critère d’hétérogénéité de Ward sur deux matrices différentes. Le package ClustGeo permet également d’afficher les typologies obtenues sur une carte par le biais des shapefiles relatifs aux observations.

La présentation qu’il a donné aux Rencontres R est disponible ici.
Le package est disponible sur le CRAN et sur GitHub.