Lors des Quatrièmes Rencontres R (24-26 juin 2015 à Grenoble), Amaury Labenne (de l’IRSTEA) a présenté son package ClustGeo qui permet de réaliser des Classifications Ascendantes Hiérarchiques avec contraintes de proximité géographique. Voici la présentation qu’il en fait :

La Classification Ascendante Hierarchique (CAH) est une méthode bien connue de clustering d’observations qui consiste à regrouper dans une même classe des observations qui se ressemblent. Cependant, lorsque les observations sont des unités spatiales, on désire parfois que des observations proches géographiquement se retrouvent dans une même classe sans trop dégrader la qualité de la partition. La méthode hclustgeo du package ClustGeo permet d’intégrer de l’information géographique au sein de la CAH en utilisant un critère d’hétérogénéité de Ward sur deux matrices différentes. Le package ClustGeo permet également d’afficher les typologies obtenues sur une carte par le biais des shapefiles relatifs aux observations.

La présentation qu’il a donné aux Rencontres R est disponible ici.
Le package est disponible sur le CRAN et sur GitHub.